el project64 1.7.0.49 te incluye bastantes gameshark para el zelda ocarina of Time Master Quest y muchisimos otros mas juegos, para activarlos has lo siguiente,
ve al menú opciones ---> configuración ---> pestaña opciones --_> quita la seleccion a Esconder configuración avanzada, y marca la casilla recordar Cheats escogidos
ahora crea una carpeta donde tengas todos tus roms ---> ve al menu archivo ---> selecciona Escoger Directorio de Roms y elige la carpeta, en el emulador te aparecerá una lista con todos los Rom que tienes, ahora selecciona tu Rom, das click con el bton derecho de mouse encima, te aparecerá un menú contextual, selecciona, Edita Cheats, una vez allí podrás seleccionar el Cheat que quieras activar y cada vez que abras el Rom estará activado, también puedes añadir y/o modifcarlos