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1 - El primer y el ultimo Pokemon.
El primer Pokemon creado fue Rhydon. Aparecía en un dibujo que fue presentado cuando empezaron el proyecto, acompañando a Red . No solo fue el primero en ser dibujado, sino que fue el primero en ser programado, como indica que tenga el indice interno 001. Este indice es un número que tiene cada Pokemon en el juego y que esta oculto, marcando el orden en que fueron añadidos sus datos al juego.
Curiosamente, el ultimo fue Mew, ya que fue añadido en el ultimo momento, al ver que tras borrar datos de control quedaba espacio para añadir un Pokemon.
2 - La batalla contra el profesor Oak.
Antes de ser un investigador Pokemon, Oak fue un gran entrenador. Cuando empezaron a desarrollar el juego, estaba pensado que nos lo demostraría en persona. Con el glitch de missigno, se puede acceder a la batalla contra Oak, que no ha sido eliminada totalmente, y nos demuestra que iba ser algo parecido a la batalla contra Red en oro y plata. Oak tendría el tercer Starter (El que no lleva ni el jugador ni su rival), un Tauros, un Exeggutor, un Arcanine y un Gyarados a un nivel bastante más alto del de los Pokemon del alto mando, dando a entender que iba ser el reto definitivo para los entrenadores.
3 - Pokemon tipo pájaro.
En los primeros diseños, había un Bird Type(Tipo pájaro), que finalmente se sustituyó por el tipo Volador. La decisión se tomo según se añadían Pokemon, al ver que no todos los voladores eran aves. Curiosamente, no se hizo una sustitución completa, el tipo pájaro se mantuvo como un tipo aparte del que no hay ningún pokemon en el juego, excepto Missigno que a veces presenta el tipo pájaro/normal.
4 - La posibilidad de elegir entre entrenador y entrenadora.
Se iba poder elegir entre un entrenador y una entrenadora, pero esta posibilidad se descartó y al final no se añadió al juego hasta la edición cristal en la segunda generación. El diseño de la entrenadora se reutilizó para el personaje de Blue en el manga Pokemon Special.
5 - Objetos eliminados o cambiados.
Hubo varios objetos que fueron borrados o que se cambio su uso en la versión final del juego. Las medallas aparecían en la mochila como un objeto clave más, y estaba previsto que se pudieran usar en combate obteniendo cierta ventaja con ellas. También podríamos usar la Pokedex en la batalla, seguramente para obtener datos del rival.
????? es una tabla de surf, todavía accesible mediante gamesharks, que servía para surfear sin un Pokemon con surf. No esta claro si iba ser un objeto presente en el juego o lo usaron durante la programación para hacer pruebas.
En las betas estaban previstas varias MT/MO más que las que finalmente aparecen en el juego, pero nunca llegaron a ser programadas.
6 - Diseños de Pokemon.
Buhi ocupaba el nº 124, pero fue sustituido por Jynx:

Papyō iba ser el 211, lo que nos indica que el juego iba ser mucho más largo de lo que finalmente fue:

Godzillante & Gorillaimo, aparecen en una imagen de ejemplo de como iban ser las batallas. Solo se sabe que Godzillante era tipo fuego y estaba basado en Godzilla.

Dragon4 era el 174 y tiene aspecto de ser un diseño de Pokemon Dragon genérico que un Pokemon que realmente fuera aparecer en el juego.
Kokana, un Pokemon bicho que seguramente se acabó transformando en Weedle:

Kasanagi era la evolución de Kokana. Fue sustituido por Kakuna en la versión final.

"undecided" era la evolución de Kasanagi. Fue presentado junto a los otros dos, pero no tenía nombre aun. Pudo servir como base para Ledyba. Beedrill apareció en su lugar.

¿Gengar y Nidorino? En una imagen del diseño de la intro del juego aparecen los que serían Gengar y Nidorino en la versión final, aunque parece que el diseño original de Nidorino fue reutilizado en Feraligart.

Nyosuka es una versión inicial de Poliwarth:

Lapras

Karabajio VS. Mimii, primeras versiones de Blastoise y Staryu:

Un Pokemon desconocido saliendo de un huevo:

1 - Primeras imágenes.
Cuando GameFreak anunció Pocket Monster 2: Gold and Silver, mostró una imagen en la que aparecen dos entrenadores, posiblemente los primeros diseños de los protagonistas y varios nuevos pokemon, algunos que no han aparecido finalmente en el juego:
Otra imagen de la misma epoca, mostraba a Silver y un nuevo Pokemon que todos conocemos.
El desarrollo de la segunda generación fue muy largo, ya que se retraso durante dos años y muchas cosas cambiaron desde que se mostraron estas imágenes hasta que vimos el juego final.
2 - Imágenes del juego.
Entre las imágenes del juego que se mostraron en un principio, había lugares conocidos bastante similares al resultado final...
...otros que cambiaron totalmente, como el lago de la Furia, en el que había un pueblo con gimnasio incluido...
... y otros que simplemente nunca llegamos a ver, como una especie de primera versión de las ruinas Unown situadas en una ciudad o pueblo.
Además, los remolinos iban aparecer como obstaculos aleatorios en las zonas en que se podía surfear.
3 - El monopatín.
Entre las novedades anunciadas estaba un monopatín que servia para llegar a lugares poco accesibles. Una especie de primera versión de la bici acrobática, aunque nunca llego a tener una versión funcional programada. Curiosamente en el manga Pokemon Special, Gold lleva un monopatín en vez de una bicicleta, de lo que se deduce que realmente la idea estuvo ahí hasta el final.
4 - Kanto.
Kanto, la región de la primera generación que era accesible una vez que ganabas la liga iba tener más peso en el juego. Había programados mapas para el Bosque Verde, la Cueva Celeste y Isla Canela, pero se eliminaron de la versión final.
Además había un mapa de la Zona Safari, que aunque es inaccesible, sigue estando en la versión final del juego y tiene programados Pokemon salvajes por lo que debió ser eliminada muy al final del desarrollo.
Cal, el rival contra el que luchas en Trainer's House, aparecía con otro equipo diferente, más débil, por lo que se eliminó una batalla contra el en una parte más temprana del argumento del juego.
5 - Diseños de Pokemon.
Primero, vamos con los que llegamos a ver. Aparte del primer diseño de Tyranitar, que aparecía entre las primeras imágenes de la generación, hubo otros Pokemon que sufrieron cambios notables antes de aparecer en la versión final del juego:
Mareep
Girafarig
Quilfish
y Chikorita.
Y hubo otros que nunca llegamos a ver.
Mariru ¿Relacionado con Marill? -> Confirmado. Reutilizaron el diseño y el nombre con algunos cambios para crear a Marill.
Kurusu ¿Preevolucion de Seel?
Honooguma ¿Pikachu de tipo fuego?
Kage no Mushi ¿Primera versión de Sewaddle?

Y los dos que acompañaban a Tyranitar, una especie de tortuga y otro similar a Clefairy y Jigglypuff.
Lo he comprobado, y aunque no esta confirmado es lo que se rumorea, que o es Hitmontop o Tyrogue.
6 - Objetos.
Varios objetos de la primera generación, como la pokeflauta y el mapa estaban en las primeras versiones programadas. Se eliminaron del juego, pero no del código, por lo que se pueden obtener con gamesharks.
El objeto Sweet Honey estaba previsto que se usara junto a arboles especiales para atraer Pokemon que vivían en los arboles( ¿A alguien le suena esto ?), pero finalmente se sustituyó por el movimiento Golpe Cabeza.
Había varias MT y MO pensadas que nunca vieron la luz. Lo más llamativo es que eran 12 MO lo que habían planeado.
7 - Otros.
Se eliminaron un evento en la Torre quemada relacionado con una niña desaparecida, otro relacionado con Hentei y la posibilidad de elegir el nombre de la madre del protagonista, de Red y de Green.

1 - Cambio total.
Al pasar de GBC a GBA, el juego tuvo que ser reprogramadado desde cero, ya que la forma de funcionar de la nueva consola era muy diferente de la de la anterior. En ese momento se plantearon cambios bastante radicales, como aumentar el número de Pokemon que un entrenador puede llevar con el o el número de ataques que pueden aprender. Finalmente decidieron mantener la linea seguida en las ediciones anteriores.
2 - Combates dobles.
Aparte de los combates dobles contra entrenadores, iba haber combates dobles contra Pokemon salvajes. Esto se sabe porque dentro del código del juego (visto por personas que hacen Hacks) aparece un mensaje no utilizado "Wild \v[&H05] and \v[&H03] appeared!".
3 - Habilidades.
Hay una habilidad llamada Cacophony que no llego a la versión final del juego. Se supone que la sustituyó la habilidad "Insonorizar" porque ambas se basan en el sonido, aunque no es seguro porque podrían ser habilidades totalmente diferentes.
4 - Islas.
En Rojo Fuego y Verde Hoja hay varias islas no mostradas en el juego que podrían ser parte de las Sevii Island. De hecho alguna si se sabe que iba estar entre ellas.
Estas son las Islas 8 y 9...
... y estas no se sabe que iban a ser:
5 - Clima.
Al usar como base Rubi y Esmeralda para crear Rojo Fuego y Verde Hoja, las betas tenían los mismos efectos de clima que estos.
6 - Pokemon.
Shelos y Gastrodon fueron creados en esta generación pero no usados en la versión final:
Treecko
Groundon
Torchick
Ahora viene lo mejor...

7 - Otros.
Archie aparecía con un Toguetic al nivel 17 en las betas. Sharpedo no era la evolución de Carvanha. Existia una Special Area en la versión Esmeralda.